Skābeklis ir bezkrāsaina, bez smaržas un garšas gāze. Gāzes (gaisa = 1) relatīvais blīvums 21,1°C un 101,3kPa ir 1,105, un šķidruma blīvums viršanas temperatūrā ir 1141 kg/m3. Skābeklis nav toksisks, bet pakļaušana lielai koncentrācijai var negatīvi ietekmēt plaušas un centrālo nervu sistēmu. Skābekli var transportēt ar spiedienu 13790 kPa kā nesašķidrinātu gāzi vai kā kriogēnu šķidrumu. Daudzās ķīmiskās rūpniecības oksidācijas reakcijās gaisa vietā izmanto tīru skābekli, lai gūtu labumu no lielāka reakcijas ātruma, vieglākas produktu atdalīšanas, lielākas caurlaides vai mazāka aprīkojuma.