Deguonis yra bespalvės, bekvapės, beskonės dujos. Santykinis dujų tankis (oras=1) esant 21,1°C ir 101,3kPa yra 1,105, o skysčio tankis virimo temperatūroje yra 1141 kg/m3. Deguonis nėra toksiškas, tačiau didelės koncentracijos poveikis gali neigiamai paveikti plaučius ir centrinę nervų sistemą. Deguonis gali būti transportuojamas esant 13790 kPa slėgiui kaip nesuskystintos dujos arba kaip kriogeninis skystis. Daugelyje chemijos pramonės oksidacijos reakcijų naudojamas grynas deguonis, o ne oras, siekiant gauti naudos iš didesnio reakcijos greičio, lengvesnio produktų atskyrimo, didesnio našumo ar mažesnio įrangos dydžio.