Glavni izvor helija su izvori prirodnog plina. Dobiva se postupcima ukapljivanja i uklanjanja helija. Zbog nestašice helija u svijetu, mnoge primjene imaju sustave za obnavljanje helija.
Helij ima važne primjene u zrakoplovnom sektoru, kao što je plin za isporuku i stlačenje pogonskih goriva raketa i svemirskih letjelica, te kao sredstvo za stlačenje fluidnih sustava na zemlji i u letu. Zbog svoje male gustoće i stabilne prirode, helij se često koristi za punjenje balona za promatranje vremena i balona za zabavu kako bi se osigurao uzgon. Helij je sigurniji od zapaljivog vodika jer ne gori niti uzrokuje eksploziju. Tekući helij može pružiti okruženje ekstremno niske temperature za korištenje u supravodljivoj tehnologiji i magnetskoj rezonanciji (MRI), održavajući uvjete ekstremno niske temperature potrebne za supravodljive magnete.

U medicinskom području, helij se koristi za održavanje kriogenog okruženja za supravodiče u uređajima za magnetsku rezonanciju i za komplementarne tretmane kao što je respiratorna podrška. Helij djeluje kao inertni zaštitni plin za sprječavanje oksidacijskih reakcija tijekom zavarivanja, a također se koristi u tehnologiji otkrivanja plina i otkrivanja curenja kako bi se osigurala nepropusnost opreme i sustava. U znanstvenim istraživanjima i laboratorijima, helij se često koristi kao plin nosač za plinsku kromatografiju, osiguravajući stabilno eksperimentalno okruženje. U procesu proizvodnje poluvodiča, helij se koristi za hlađenje i stvaranje čistog okoliša, čime se osigurava stabilnost proizvodnog procesa i kvaliteta proizvoda.